CSSを使えばスクロールバーの色を自由に変更する事が出来ますが、全ての部分を同じ色にしていてスクロールバーが表示されないサイトがたまにあります。

また、スクロールバーの外側の部分(scrollbar-3dlight-colorとscrollbar-darkshadow-color)だけに色を付けて他は真っ白に設定しているサイトがありますが、この場合、ブラウザによってはスクロールバーが全く見えなくなってしまう事があります。

実際、私の使っているunDonutというブラウザではそれに該当する部分が無いので、そのようなサイトではスクロールバーが全く表示されません。

スクロールバーが見えないと、スクロールしようとして適当な部分をクリックした場合、予期せぬ場所に移動してしまったりすることが多々あります。
マウスのホイールを使うにしても、まとめてスクロール出来ないので使いにくいです。

サイト制作者が何を意図してスクロールバーを隠しているのかは分かりませんが、訪問者にとっては非常に迷惑なのでやめて頂きたいです。
また、上に書いたとおり、スクロールバーを隠すつもりはなくてもブラウザによってはそうなってしまう場合もあるので注意して下さい。

以下サンプルです。

実際にはスクロールバーがあるのですが、他の部分と色が同じなので見えません。
(スクロールバーの色変更はIE5.5以上対応です。他のブラウザでは普通に見えます。)